Nova técnica permite sequenciamento genético de qualquer bactéria

São Paulo — Pesquisadores desenvolveram um novo método para sequenciar e analisar o genoma de até 99,9% das espécies de bactérias. São organismos que não podem ser criados em laboratório em quantidades suficientes para serem sequenciados geneticamente pelas técnicas disponíveis. Entre eles estão desde micro-organismos que produzem antibióticos e biocombustíveis a micróbios que vivem no corpo humano.

No método tradicional, os especialistas precisam de pelo menos um bilhão de células idênticas criadas em cultura no laboratório para poder sequenciar o DNA de um organismo. Agora, cientistas da Universidade de San Diego, do Instituto J. Craig Venter e da empresa Illumina, desenvolveram um algoritmo que potencializa uma técnica já existente para sequenciar o genoma a partir de uma única célula bacteriana, quase com a mesma precisão dos métodos tradicionais. O trabalho foi publicado no periódico Nature Biotechnology.

Os cientistas desenvolveram um algoritmo que melhora muito o rendimento do programa de computador usado para sequenciar DNA produzido a partir de uma única célula bacteriana. Tradicionalmente, esses programas resgatam 70% dos genes. "O novo algoritmo captura 90% do material genético de uma única célula", disse o cientista da computação Pavel Pevzner, da Universidade de San Diego, especialista em programas de sequenciamento genético. Não é 100%, mas é quase tão bom quanto às tecnologias atuais, afirma o pesquisador. "Hoje, os biólogos conseguem capturar 95% dos genes, mas eles precisam cultivar um bilhão de células para isso", disse Glenn Tesler, matemático e parceiro de Pevzner na pesquisa.

Dificuldades

As bactérias têm um papel vital na saúde humana. Elas representam 10% do peso do corpo e podem ser encontradas em todas as partes, do estômago à boca. Algumas, como a Escherichia coli, podem causar problemas graves. Outras nos ajudam a fazer a digestão. Estudos recentes descobriram que algumas delas podem até mudar o nosso comportamento, por exemplo, diminuindo o stress. Para entender o comportamento das bactérias, os cientistas precisam analisar o genoma delas.